本所於民國四十年五月三十日成立於高雄市大同一路 161 號,設立以預防注射及門診二項業務為主,人員編制四位分別為主任兼醫師、助產士、護士、事務員。於民國四十三年遷移至大同一路 141 號,民國五十年再增列保健員 2 名。於民國六十八年因高雄市改制為直轄市,得因增列二組編制。八十七年遷移至中正三路 25 號 4 樓(高雄市財稅行政大樓)並於一百零四年將前金區衛生所.鹽埕區衛生所及新興區衛生所整併成為一所名為高雄市新興衛生所。為加強執行公共衛生政令,提高為民服務績效,推行各項公共衛生、醫療保健及防疫業務,堅持著為民服務理念,本所工作團隊積極做好預防保健、防疫及人文的理念之為民服務工作。